Membros do CIDES colaboraram e colaboram ainda na lecionação de unidades curriculares da Licenciatura em Ciências da Nutrição do ISCNAUP – atua Faculdade de Ciências da Nutrição e Alimentação da Universidade do Portol FCNAUP (de 1994/95 a 1997/98), da Licenciatura em Medicina Dentária da Faculdade de Medicina Dentária da Universidade do Porto FMDUP (de 1995/96 até 2004/2005), da Licenciatura em Enfermagem da Escola de Ciências da Saúde - Universidade do Minho ESEUM (desde 2009), da Licenciatura em Ciências Biomédicas da UA (desde 2008), e da Licenciatura em Farmácia da Cooperativa de Ensino Superior, Politécnico e Universitário CESPU (desde 2009).

O CIDES tem sido responsável pela lecionação de unidades curriculares do Mestrado Integrado em Medicina da FMUP (desde 1994 até à data) e membros do Departamento têm colaborado na lecionação de unidades curriculares dos seguintes Mestrados Integrados:

• Mestrado Integrado em Medicina da Escola de Ciências da Saúde - Universidade do Minho (ECSUM),
• Mestrado Integrado em Ciências Farmacêuticas da Cooperativa de Ensino Superior, Politécnico e Universitário (CESPU),
• Mestrado Integrado em Medicina Dentária da Cooperativa de Ensino Superior, Politécnico e Universitário (CESPU),
• Mestrado Integrado em Ciências Farmacêuticas da Universidade Fernando Pessoa (UFP).

O CIDES tem sido ainda responsável pela organização dos seguintes cursos de Mestrado/2os Ciclos de Estudos:

• 2º Ciclo de Estudos/Mestrado em Informática Médica (com a Faculdade de Ciências da Universidade do Porto)
• 2º Ciclo de Estudos/Mestrado em Evidência e Decisão em Saúde

Membros do CIDES colaboraram e têm ainda colaborado com diversas instituições de ensino superior, em unidades curriculares dos seguintes cursos de Mestrado:

• Faculdade de Medicina da Universidade do Porto - FMUP - (Mestrado em Saúde Pública, Mestrado em Biologia Humana, Mestrado em Ciências da Enfermagem – Pediatria, Mestrado em Cuidados Paliativos, Mestrado em Genética Humana Aplicada, Mestrado em Gestão e Economia da Saúde (com a Escola de Economia e Gestão da Universidade do Minho), Mestrado em Ortodontia, Pós-Graduação em Medicina do Trabalho
• Faculdade de Ciências da Nutrição e Alimentação da Universidade do Porto - FCNAUP - Mestrado em Nutrição Clínica
• Faculdade de Medicina Dentária da Universidade do Porto - FMDUP - Mestrado em Cirurgia Oral, Mestrado em Implantologia, Mestrado em Odontopediatria, Mestrado em Reabilitação Oral, Mestrado em Saúde Oral e Comunitária
• Faculdade de Engenharia da Universidade do Porto - FEUP - Mestrado em Engenharia Biomédica
• Universidade do Minho - Mestrado em Psicologia Clínica.
• Universidade de Aveiro - Mestrado em Biomedicina Farmacêutica.
• Instituto Superior da Maia-  ISMAI - Pós-Graduação em Gestão dos Estabelecimentos e Serviços de Saúde, Pós-Graduação em Gestão e Administração em Saúde
• ESEP – Mestrado em Sistemas de Informação em Enfermagem

O CIDES tem sido ainda responsável pela organização do 3º Ciclo de Estudos/Programa Doutoral em Investigação Clínica e em Serviços de Saúde
Membros do CIDES colaboraram e têm ainda colaborado com diversas instituições de ensino superior, em unidades curriculares dos seguintes cursos de Doutoramento/Programas Doutorais e 3 os Ciclos de Estudos:

• Faculdade de Medicina da Universidade do Porto - FMUP - (Programa Doutoral em Saúde Pública)
• Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar - ICBAS - Programa GABBA
• Faculdade de Psicologia e de Ciências da Educação da Universidade do Porto - FPCEUP - Programa de Doutoramento em Psicologia
• Programa de Formação Médica Avançada da Fundação Calouste Gulbenkian*

* o PFMA da FCG, com a duração de 1 ano, não confere grau. O grau é atribuído mediante a realização e aprovação em Provas Públicas, de um doutoramento/programa doutoral das: Universidade do Porto, Universidade de Lisboa e Universidade Nova de lisboa.

O CIDES, desde 1995, tem organizado e colaborado módulos/sessões de cursos de formação contínua pós-graduada (não conferente de grau), tais como: o Curso Básico de Bioestatística, o Curso de Actualização em Farmacovigilância, o Curso de Estatística, o Curso de Internet, o Curso de Metodologia Básica de Investigação Científica, o Curso de Metodologia de Investigação Clínica e Medicina Baseada na Evidência e Bioestatística, o Curso de Metodologia de Investigação e Análise de Dados, o Curso de Metodologia de Investigação Médica, o Curso de Processamento de Texto em MSWord, o Curso Básico de Estatística Médica, o Curso de Informática Médica - Computadores, Internet e Medicina, destacando-se a este nível a organização anual (desde 2006), das Escolas de Verão.

Estes cursos de formação realizam-se no âmbito de parcerias com diversas instituições de saúde/ensino, designadamente: o Hospital Maria Pia, o Hospital Pedro Hispano, o Hospital de Santo André, o Hospital da Prelada, o Departamento de Educação Permanente do Centro Hospitalar de S.João, a Unidade de Farmacovigilância do Norte, a Astrazeneca, a Sociedade Portuguesa de Pediatria, a Faculdade de Medicina da Universidade Agostinho Neto (Angola), a Universidade Privada de Luanda (Angola), o Instituto Nacional de Saúde Pública (Guiné Bissau) e o Instituto Nacional de Administração I.P., entre outros.